توسعه نوآوری شهری و ارتقای شاخصهای مرتبط با آن، از حوزههای مورد توجه در اکثر شهرهای هوشمند است. در برنامه تهران هوشمند نیز همگام با سایر شهرهای هوشمند، سرفصل ویژهای با عنوان تهران نوآور به موضوع توسعه زیست بوم نوآوری شهری در تهران و حمایت از شرکتهای استارتاپی و دانشبنیان اختصاص یافته است.
از اقدامات این حوزه میتوان به ایجاد فنبازار تخصصی شهرهوشمند، احصاء و انتشار ۴۰۰ نیاز فناورانه و نوآورانه شهرداری، ایجاد مراکز نوآوری شهر هوشمند در مناطق مختلف تهران و نیز تسهیل استقرار کسب و کارهای نوآور در شهر اشاره کرد.